Vous trouvez au sein de cette liste déroulante, les différents équipements qui composent la plateforme IMA’CRI :
[:fr]Confocal Zeiss LSM 780 Airyscan[:]
Le microscope confocal inversé Zeiss LSM 780, piloté par le logiciel ZEN équipé d’une chambre thermostatée, est totalement motorisée et permet l’observation sub-cellulaire d’échantillons fixées ou de cellules vivantes. Ce microscope est équipé d’une barette spectral permettant de faire jusqu’à 8 couleurs en simultané et d’un détecteur de haute résolution permettant d’améliorer la résolution d’un facteur 1,7.
Technologies associées :
Imagerie 2D
Imagerie 3D
FRAP photoactivation
FRET ratiométrique
Imagerie spectrale
Imagerie haute résolution
Objectifs disponibles
| Objectifs | Ouverture Numérique | Immersion |
| X10 Plan Apo | 0.45 DF= 2,1 mm | sec |
| X40 W C-Apo | 1.2 DF= 280 µm | eau |
| X40 DIC Plan Apo | 1.3 DF= 200 µm | huile |
| X63 DIC Plan Apo | 1.4 DF= 190 µm | huile |
Les sources lasers
– Diode 405nm, 30mW
– Laser Argon, raies à 458, 488, 514 nm, 25mW
– Diode à 561nm, 20 mW
– Diode 633 nm, 5mW
Les détecteurs
2 PMT (photocathode à revêtement multialcalin), dont un refroidi
1 PMT transmission
1 multiPMT (photocathode GaAsP) 32 canaux refroidi pour la détection spectrale.
1 détecteur Airyscan constitué de 32 détecteurs GaAsP organisés en nid d’abeille
[:fr]Confocal Multiphoton Leica SP8[:]
Le microscope confocal droit Sp8 Leica, piloté par le logiciel LAS X qui permet l’observation sub-cellulaire d’échantillons fixées ou de cellules vivantes. Il est équipé d’un logiciel de déconvolution permettant d’améliorer la résolution.
Technologies associées:
Imagerie 2D
Imagerie 3D
Imagerie multiphoton
Objectifs disponibles
| Objectifs | Ouverture Numérique | Immersion |
| X25 PL IRAPO | 0.95 DT= 2,5 mm | eau |
| X40 PLAN APO | 1.3 DT=240 µm | huile |
| X63 PLAN APO | 1.4 DT = 280 µm | huile |
Les sources lasers
– Diode 405 nm, 50 mW
– Argon Multilines à 458, 488, 514 nm, 65 mW
– Diode à 561 nm, 20 mW
– Diode 633 nm, 10 mW
– Laser IR Coherent Chameleon Vision II précompensé accordable de 680 1080 nm . Il possède (500-550, 565-605) pour une observation maximale.
Les détecteurs
Il est équipe de 2 PMTs et d’un détecteur HyD
[:fr]Vidéomicroscope-TIRF Zeiss Axiovert 200[:]
Ce microscope inversé permet de réaliser des times lapses en lumière transmise et en fluorescence sur cellules vivantes. Il permet également de faire du TIRF.
Filtres
GFP/mRFP EX DBP 480/30 + 565/25. EM DBP 525/31 + 616/57
Il est équipé :
– d’une chambre thermostatée et régulée en CO2 pour étude sur cellules vivantes
– d’une platine motorisée XYZ
– d’une caméra haute Résolution Cool Snap HQ2
– d’une caméra Evolve EMCCD
– d’une DG4 avec filtre Fura2 permettant la détection de Calcium
Objectifs disponibles
| Objectifs | Ouverture Numérique | Immersion |
| X2.5 Plan-Neofluar | 0,075 df=9,5 mm | sec |
| X5 Plan-Neofluar | 0,16 df= 18,5 mm | sec |
| X10 Ph 1 Plan-Neofluar | 0.5 df= 5,2 mm | sec |
| X20 Ph2 Plan-Neofluar | 0.5 df= 2 mm | sec |
| X40 DIC Plan-Apo | 1.3 df= 0,2 mm | huile |
| X63DIC Plan-Apo | 1.4 df= 0,19 mm | huile |
| X100 DIC Plan-Apo | 1.46 df= 0,10 mm | huile |
Blocs filtres
| Monobande HE | Multibandes | Multibandes |
| DAPI EM EX G 365BP 445/50 | GFP/mRFP | DAPI/GFP/Cy3/Cy5 |
| eGFP EX BP 470/40, EM BP 525/50 | CFP/YFP | |
| CFP EX BP 550/25, EM BP 480/40 | Fura 2, EX BP 340/30, EM BP 690/50 | |
| YFP EX BP 500/25, EM BP 535/30 | ||
| Cya3 EX BP 436/25, EM BP 605/70 | ||
| Cya5 EX BP 640/30, EM BP 690/50 |
[:fr]Logiciel analyse d’images[:]
Imaris est un logiciel de reconstruction 3D/4D, édité par la société Bitplane. Il permet de visualiser, les images prises en microscopie photonique, par reconstruction volumique et surfacique. IL est en libre service sur la Plate-Forme après réservation sur le site de ressources du CRI.
Fiji est très complet pour l’analyse d’image (co-localisation, traitement de stacks (pile d’images), colorimétrie, recherche de contours, segmentation, projection z, overlay, filtres, 3D, création d’animations .AVI .GIF, déconvolution 3D, …) et permet de créer des macros.
Site officiel: https://imagej.net/Fiji
[:fr]X Clarity Biologos[:]
Les systèmes et réactifs X-CLARITY ™ standardisent, simplifient et accélèrent chaque étape du processus de nettoyage des tissus. Avec la méthode CLARITY, les tissus préservés sont intégrés dans une matrice d’hydrogel et les lipides sont activement extraits par électrophorèse pour créer un hybride tissu-hydrogel stable et optiquement transparent qui est chimiquement accessible pour plusieurs cycles d’étiquetage et d’imagerie des anticorps. La cytoarchitecture native reste intacte et même les protéines de fluorescence endogènes sont préservées pour une imagerie de fluorescence robuste en aval.
